Το Μουσείο Φυσικής Ιστορίας στην Αξιούπολη διατηρεί και παρουσιάζει πλήθος συλλογών σχετικών με τον φυσικό πλούτο της περιοχής. Μέσω πέντε θεματικών ενοτήτων (Βοτανική, Πανίδα, Γεωλογία, Παλαιοντολογία, Πετρώματα & Ορυκτολογία), ο επισκέπτης έρχεται σε επαφή με τα περιβαλλοντικά στοιχεία του Πάικου, του Μπέλλες, της λίμνης Κερκίνης, όλων των μορφών ζωής αυτής της μαγευτικής περιοχής της Κεντρικής Μακεδονίας που σηματοδοτούν οι δύο αντικριστοί ορεινοί όγκοι και οι άνθρωποι που κατοικούν στη σκιά τους, στις όχθες της λίμνης και την εύφορη γη των ποταμών και των παραπόταμων που την τροφοδοτούν.

Από τις αναπαραστάσεις σπάνιων θηλαστικών, τρωκτικών και πτηνών ως τις συλλογές με τις πεταλούδες και από την παρουσίαση των γεωλογικών φαινομένων που δημιούργησαν τη γη όπως την ξέρουμε σήμερα ως τους ασπόνδυλους οργανισμούς, από τα πρώτα φυτά έως τη συλλογή περίπου 2500 δειγμάτων και από τα γιγάντια ερπετά ως την εμφάνιση του ανθρώπου, η συλλογή εισάγει τον επισκέπτη τόσο σε ένα γενικό πλαίσιο περιβαλλοντικής συνειδητοποίησης όσο και τους φυσικούς θησαυρούς της περιοχής. Σημαντική είναι και η συλλογή πετρωμάτων και ορυκτών, από την Ελλάδα και το εξωτερικό, με ταξινόμηση που επιτρέπει την κατανόηση της προέλευσης και δημιουργίας τους.